Dataset de Zenodo · Ali, Alishum
VagDB: Human specific 16s rRNA sequences for vaginal microbiome analysis
- Licencia
- CC BY 4.0uso comercial permitidoTexto de la licencia
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- Formatos
- FA
- Tamaño
- 269 MB
- Actualizado
- 27 oct 2025
Descripción
Vagina Specific databases development For taxonomy we used an in-house created vaginal microbiome-specific database that is based on the robust Genome Taxonomy Database release 207 (GTDBr207) . We further confirmed the GTDB taxonomy assignments using another vaginal microbiome-specific database based on the Silva 138 annotations (supplementary). The DADA2-formatted databases used for assignation were developed from a list of 582 human vaginal bacteria that were published. Diop, K., et al., Exhaustive repertoire of human vaginal microbiota. Human Microbiome Journal, 2019. 11 : p. 100051
Descripción de Zenodo, abreviada.
Archivos (2)
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