DH{}DataHunter

Набор данных из Zenodo · Ali, Alishum

VagDB: Human specific 16s rRNA sequences for vaginal microbiome analysis

Открыть на Zenodo
Лицензия
CC BY 4.0можно в коммерцииТекст лицензии
Лицензия разрешает коммерческое использование. Обычно нужно указать автора — точные условия в тексте лицензии.
Форматы
FA
Размер
269 МБ
Обновлён
27 окт. 2025 г.

Описание

Vagina Specific databases development For taxonomy we used an in-house created vaginal microbiome-specific database that is based on the robust Genome Taxonomy Database release 207 (GTDBr207) . We further confirmed the GTDB taxonomy assignments using another vaginal microbiome-specific database based on the Silva 138 annotations (supplementary). The DADA2-formatted databases used for assignation were developed from a list of 582 human vaginal bacteria that were published. Diop, K., et al., Exhaustive repertoire of human vaginal microbiota. Human Microbiome Journal, 2019. 11 : p. 100051

Описание из Zenodo, сокращённое.

Файлы (2)

  • FAvaginalGTDBr207Species.fa1 МБ
  • FAvaginalBactSilva138Sp.fa268 МБ

DataHunter не хранит и не раздаёт эти файлы: каждая ссылка ведёт к первоисточнику. Перед использованием проверьте там лицензию.

Найти другие наборы