DH{}DataHunter

Набор данных из Zenodo · Pyron, Robert

TetrapodTrees Database: Anthropocene Imperilment of Ancient Diversity and Evolutionary Potential in Terrestrial Vertebrates

Открыть на Zenodo
Лицензия
CC BY 4.0можно в коммерцииТекст лицензии
Лицензия разрешает коммерческое использование. Обычно нужно указать автора — точные условия в тексте лицензии.
Форматы
CSV, R, ZIP, TRE
Размер
6,8 ГБ
Обновлён
26 сент. 2025 г.

Описание

Zenodo Readme – TetrapodTrees Database The data products here are described in the preprint "Anthropocene Imperilment of Ancient Diversity and Evolutionary Potential in Terrestrial Vertebrates." Figure tree - this is a single randomly chosen tree that was used for illustration purposes in the main MS and can be used for your own quick testing and analyses: tetrapoda 1.0 33281 full.1.tre Tetrapod trees – these files contain the full 10,000 trees with 33,281 species, broken up into 10 sets of 1,000 trees: tetrapoda 1.0 33281 full.1000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.2000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.3000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.4000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.5000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.6000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.7000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.8000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.9000.trees.zip tetrapoda 1.0 33281 full.10000.trees.zip Mammal trees – these 10,000 mammal trees were re-estimated using the methods described by Upham et al. (2019) with extinctionpr = fixed(0) to equal a Yule (i.e., pure-birth) process. These trees were used to create TetrapodTrees. MamPhy fullPosterior PureBirth vr…

Описание из Zenodo, сокращённое.

Файлы (19)

  • CSVtrees.sample.csv355 кБ
  • CSVmamm_tax.csv358 кБ
  • CSVtetrapod_groups.csv989 кБ
  • CSVtipRate_SUMMARY-ED_all10ktrees_tetrapoda_1.0_33281_full.csv7,9 МБ
  • R_tetrapod_1.0.R22 кБ
  • R_Tetrapoda_tipFP_forHPC_v2.R12 кБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.5000.trees.zip614 МБ
  • CSVtipRate_SUMMARY-DR_all10ktrees_tetrapoda_1.0_33281_full.csv8,4 МБ
  • ZIPMamPhy_fullPosterior_PureBirth_vr_Completed_5911sp_topoCons_NDexp_all10k_v2_nexus.trees.zip774 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.3000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.8000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.2000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.9000.trees.zip614 МБ
  • TREtetrapoda_1.0_33281_full.1.tre1,5 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.1000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.4000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.6000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.10000.trees.zip614 МБ
  • ZIPtetrapoda_1.0_33281_full.7000.trees.zip614 МБ

DataHunter не хранит и не раздаёт эти файлы: каждая ссылка ведёт к первоисточнику. Перед использованием проверьте там лицензию.

Найти другие наборы