Dataset de Zenodo · Hall, Michael B.
Mycobacterium genus database
- Licencia
- CC0 1.0uso comercial permitidoTexto de la licencia
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- Formatos
- GZ, CSV, IDS
- Tamaño
- 533 MB
- Actualizado
- 15 feb 2024
Descripción
The database is built as a Mycobacterium -specific one. For this database, we used genome updater.sh (v0.6.3; https://github.com/pirovc/genome updater) genome updater.sh -d "refseq" -g "bacteria" -T "g Mycobacterium" -f "genomic.fna.gz" -M "gtdb" -A 1 -m In addition, we added 17 high-quality M. tuberculosis genomes to this collection (from https://doi.org/10.1186/s13059-021-02474-0 - see mtb gramtools lineages.csv for the list of accessions). The mtb.ids file lists the sequence identifiers for those sequences in the database which are M. tuberculosis .
Descripción de Zenodo, abreviada.
Archivos (3)
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