DH{}DataHunter

Набор данных из Zenodo · Hall, Michael B.

Mycobacterium genus database

Открыть на Zenodo
Лицензия
CC0 1.0можно в коммерцииТекст лицензии
Лицензия разрешает коммерческое использование. Обычно нужно указать автора — точные условия в тексте лицензии.
Форматы
GZ, CSV, IDS
Размер
533 МБ
Обновлён
15 февр. 2024 г.

Описание

The database is built as a Mycobacterium -specific one. For this database, we used genome updater.sh (v0.6.3; https://github.com/pirovc/genome updater) genome updater.sh -d "refseq" -g "bacteria" -T "g Mycobacterium" -f "genomic.fna.gz" -M "gtdb" -A 1 -m In addition, we added 17 high-quality M. tuberculosis genomes to this collection (from https://doi.org/10.1186/s13059-021-02474-0 - see mtb gramtools lineages.csv for the list of accessions). The mtb.ids file lists the sequence identifiers for those sequences in the database which are M. tuberculosis .

Описание из Zenodo, сокращённое.

Файлы (3)

  • GZMycobacterium.rep.fna.gz533 МБ
  • CSVmtb_gramtools_lineages.csv437 Б
  • IDSmtb.ids114 Б

DataHunter не хранит и не раздаёт эти файлы: каждая ссылка ведёт к первоисточнику. Перед использованием проверьте там лицензию.

Найти другие наборы